বিভিন্ন ধরণের পিসিআর | গুরুত্বপূর্ণ ধারণামূলক MCQs

বিভিন্ন ধরণের পিসিআর (পলিমারেজ চেইন প্রতিক্রিয়া) | 7 গুরুত্বপূর্ণ ধারণামূলক এমসিকিউ (সমাধান)

Contents [show]

বিভিন্ন ধরণের পিসিআর

পলিমারেজ চেইন বিক্রিয়া (পিসিআর) স্ট্যান্ডার্ড পিসিআর প্রক্রিয়াতে সামান্য পরিবর্তনের ভিত্তিতে বিস্তৃতভাবে শ্রেণিবদ্ধ করা হয়। বিভিন্ন ধরণের পিসিআর নিম্নরূপ:

নেস্টেড পিসিআর

এই কৌশলটি এম্প্লিফাইড ডিএনএতে দূষিত পদার্থকে কমিয়ে আনার প্রস্তাব করেছে কারণ এলোমেলো প্রাইমারের বাইন্ডিং পরিবর্ধনের কারণে। নেস্টেড পিসিআর পরপর দুটি পিসিআর চক্রের দুটি ভিন্ন সেট প্রাইমারের সাথে সঞ্চালিত হয়। পরবর্তী সেটটি প্রাথমিক রানের পণ্যের অভ্যন্তরে গৌণ টার্গেটকে বাড়িয়ে তোলা হবে বলে আশা করা হচ্ছে। এই কৌশলটি ব্যতিক্রমীভাবে সফল, যদিও এর সাথে জড়িত ক্রমগুলি সম্পর্কে আরও অনেক বেশি জ্ঞান প্রয়োজন। 

বিপরীত পিসিআর

এটি সম্পাদনা করা হয় যখন কেবলমাত্র টেম্পলেট ডিএনএর একক অভ্যন্তরীণ ক্রমটি জানা যায়। এই কৌশলটি বিভিন্ন জিন সন্নিবেশকে flanking ক্রম সনাক্তকরণে যথাযথ। প্রক্রিয়াটি হ'ল হজম এবং টেমপ্লেট ডিএনএর স্ব-igationক্যের একটি ক্রম অন্তর্ভুক্ত করে, যার ফলস্বরূপ অজানা অনুক্রমের শেষ প্রান্তে পরিচিত সিকোয়েন্সগুলির সাথে ডিএনএর অংশগুলি থাকে।

বিভিন্ন ধরণের পিসিআর
(বিভিন্ন ধরণের পিসিআর): তাক পলিমেরেসের আণবিক কাঠামোর প্রতিনিধিত্ব https://commons.wikimedia.org/wiki/File:PDB_1ktq_EBI.jpg

বিপরীত ট্রান্সক্রিপশন পিসিআর (আরটি-পিসিআর)

এটি আরএনএ লাইব্রেরি থেকে পরিচিত ক্রম প্রসারিত এবং সনাক্ত করতে ব্যবহৃত হয়। নমুনা থেকে প্রাপ্ত আরএনএটি তখন এনজাইম রিভার্স এনজাইম ট্রান্সক্রিপ্টের ক্রিয়া দ্বারা পরিপূরক ডিএনএ (সিডিএনএ) রূপান্তরিত হয়। টিপিক্যাল পিসিআর পরে সঞ্চালিত হয়েছে। আরটি-পিসিআর সনাক্তকরণ এবং জিনের প্রকাশের সংকল্পে ব্যাপকভাবে ব্যবহৃত হয়।

বিভিন্ন ধরণের পিসিআর
(বিভিন্ন ধরণের পিসিআর): আরটি-পিসিআর জিনের এক্সপ্রেশন স্তরটি সনাক্ত করতে ফ্লুরোফোর্স ব্যবহার করে https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Molecular_Beacons.jpg

অসমমিত পিসিআর

এটি নির্বাচিতভাবে টেমপ্লেটের ডিএনএর একটি প্রান্তকে অন্যটির চেয়ে আরও প্রশস্ত করে তোলে। এটি হাইব্রিডাইজেশন অনুসন্ধানে ব্যবহৃত হয় যেখানে কেবল একটি স্ট্র্যান্ডকে আদর্শ হিসাবে বিবেচনা করা হয়। নির্বাচিত স্ট্র্যান্ডের জন্য অতিরিক্ত প্রাইমারের উপস্থিতিতে স্ট্যান্ডার্ড পিসিআর চালিয়ে আরও প্রশস্তকরণ অর্জন করা হয়। 

পরিমাণের পিসিআর (কিউ-পিসিআর)

এটি আরএনএ, সিডিএনএ বা টেম্পলেট ডিএনএর প্রাথমিক পরিমাণ পরিমাপের পরোক্ষ প্রক্রিয়া। Q-PCR সাধারণত পিসিআর পণ্যের পরিমাণ দ্রুত নির্ধারণ করতে ব্যবহৃত হয়। কিউ-পিসিআর ডিএনএ নমুনার অভ্যন্তরে নির্দিষ্ট সিকোয়েন্সগুলি সনাক্তকরণের জন্যও ব্যবহৃত হয়।

পরিমাণগত রিয়েল-টাইম পিসিআর (কিউআরটি-পিসিআর বা আরটিকিউ-পিসিআর)

এই প্রক্রিয়াটি পরিবর্ধিত পণ্যের রিয়েল-টাইম পরিমাণগুলি নিরীক্ষণ এবং পরিমাপ করতে ফ্লোরোসেন্ট রঞ্জক ব্যবহার করে। এই পরিমাণগত রিয়েল টাইম পিসিআর কিউপিআরসি-র সাথে সম্মিলনে ব্যবহৃত হয়।

টাচডাউন পিসিআর

এই কৌশলটি পিসিআর টানা দুটি চক্রের মধ্যে অ্যানেলিং তাপমাত্রা হ্রাস করে অ-নির্দিষ্ট প্রাইমার বাইন্ডিংকে হ্রাস করে।

কলোনির পিসিআর

ক্লোনস (প্রাক্তন। কলি) সঠিক লিগেশন পণ্যগুলির জন্য বিশ্লেষণ করা হয়। নির্দিষ্ট উপনিবেশটি একটি জীবাণুমুক্ত টুথপিকের মাধ্যমে বাছাই করা হয় এবং মাস্টার মিক্সে প্রবর্তিত হয়। পিসিআর 95 এ বর্ধিত সময়ের সাথে পরিচালিত হয়oC.

অ্যালেলে-নির্দিষ্ট পিসিআর

এই কৌশলটি একক নিউক্লিওটাইড পলিমর্ফিজম (এসএনপি) এর উপর ভিত্তি করে তৈরি হয়, অ্যালিল-নির্দিষ্ট পিসিআর প্রায়শই ক্লোনিং এবং ডায়াগনস্টিক উদ্দেশ্যে ব্যবহৃত হয়। অ্যালিলের ডিএনএ ক্রম এবং তাদের পার্থক্য সম্পর্কে কিছু পূর্ব জ্ঞান প্রয়োজন। অ্যাল্লে-নির্দিষ্ট পিসিআর 3 ′ প্রান্তযুক্ত প্রাইমার এসএনপি ব্যবহারের সাথে জড়িত। সফল অ্যালে-নির্দিষ্ট পিসিআর পরিবর্ধন এবং এসএনপি-নির্দিষ্ট প্রাইমারগুলি ক্রমটিতে নির্দিষ্ট এসএনপি উপস্থিতি নির্দেশ করে।

পলিমারেজ সাইক্লিং অ্যাসেমব্লিয়া (পিসিএ) বা এসেম্বলির পিসিআর

স্ট্যান্ডার্ড পিসিআর পদ্ধতি অনুসরণ করে লম্বা অলিগোনোক্লিয়োটাইডস এবং সংক্ষিপ্ত ওভারল্যাপিং বিভাগগুলির উপস্থিতিতে দীর্ঘ ডিএনএ সিকোয়েন্সগুলির কৃত্রিম উত্পাদনকে অন্তর্ভুক্ত করে। দীর্ঘ অলিগোনুক্লিওটাইডগুলি উভয় দিক (সংবেদন এবং বিরোধী জ্ঞান) এ উল্টায়, ওভারল্যাপিং বিভাগটি পিসিআর খণ্ডগুলির ক্রম স্থির করে, চূড়ান্ত দীর্ঘ ডিএনএর নির্বাচনী উত্পাদনকে সহজতর করে।

লিনিয়ার-পরে-তাত্পর্যপূর্ণ পিসিআর (লেট-পিসিআর)

এই কৌশলটিতে, সীমাবদ্ধ প্রাইমার (কম পরিমাণে প্রাইমারের উপস্থিতি) প্রতিক্রিয়া দক্ষতা বজায় রাখার জন্য অতিরিক্ত প্রাইমার (পর্যাপ্ত পরিমাণে প্রাইমার উপস্থিত) থেকে একটি উচ্চ গলনাঙ্ক রয়েছে যেহেতু সীমাবদ্ধ প্রাইমারের ঘনত্ব প্রতিক্রিয়াটির মাঝখানে হ্রাস পায় । 

ডায়াল আউট পিসিআর

এটি জিন সংশ্লেষণের জন্য ডিএনএ অণু পুনরুদ্ধারের একটি পদ্ধতি। ডিএনএর একটি লাইব্রেরি সিকোয়েন্সিংয়ের আগে নির্দিষ্ট ফ্ল্যাঙ্কিং ট্যাগগুলির সাথে সংশোধন করা হয়। পরে, ট্যাগ নির্দেশিত প্রাইমরা পিসিআর দ্বারা পছন্দসই সিকোয়েন্সগুলির ডিএনএ পুনরুদ্ধারের অনুমতি দেয়।

হেলিক্যাস-নির্ভরশীল পরিবর্ধন

এটি প্রচলিত পিসিআর সম্পর্কিত, তবে এটি সাইক্লিংয়ের পরিবর্তে স্থির তাপমাত্রা ব্যবহার করে। ডিএনএ হেলিক্যাস তাপীয় বিচ্ছিন্নতার পদক্ষেপের পরিবর্তে ব্যবহৃত হয়। 

হট স্টার্ট পিসিআর

এই কৌশলটি পিসিআর এর প্রাথমিক চক্র চলাকালীন অ-নির্দিষ্ট প্রসারিত হওয়ার সম্ভাবনা বন্ধ করে দেয়। প্রতিক্রিয়া উপাদানগুলি 95 টি হ্রাসকারী তাপমাত্রায় উত্তপ্ত হয়oপলিমেরেজ যোগ করার আগে সি। ডিএনএ পলিমেরেজ ক্রিয়াকলাপকে বাধা দিতে প্রতিক্রিয়া মিশ্রণে ইনহিবিটার এবং অ্যান্টিবডিগুলি প্রবর্তন করা হয়, যা উচ্চ তাপমাত্রায় বিচ্ছিন্ন হয়। 

বিভিন্ন ধরণের পিসিআর
(বিভিন্ন ধরণের পিসিআর): থার্মো-স্থিতিশীল ডিএনএ (টাক) পলিমেরেজ অত্যন্ত উচ্চ তাপমাত্রায় ডিএনএ সংশ্লেষণকে অনুঘটক করে।

আন্ত-সিকোয়েন্স নির্দিষ্ট পিসিআর

পিসিআর কৌশলটির এই পরিবর্তনটি প্রায়শই ডিএনএ ফিঙ্গারপ্রিন্টিংয়ের জন্য ব্যবহৃত হয়, যার জন্য প্রবাহিত ডিএনএ খণ্ডগুলির একটি অনন্য এবং নির্দিষ্ট ফিঙ্গারপ্রিন্ট / প্যাটার্ন তৈরি করতে সাধারণ সিকোয়েন্সগুলির মধ্যে পুনরাবৃত্তি করা অঞ্চলগুলির প্রশস্তকরণ প্রয়োজন। 

লিগেশন মধ্যস্থতা পিসিআর

এটি বিশেষত ডিএনএর ছোট লিঙ্কার অণুগুলি (sertedোকানোর জন্য) এবং লিঙ্কার ডিএনএ দিয়ে অ্যানেলিংয়ে সক্ষম বিভিন্ন প্রাইমারকে ব্যবহার করে। এই কৌশলটি ডিএনএ সিকোয়েন্সিং এবং পাদ-মুদ্রণের জন্য ব্যাপকভাবে ব্যবহৃত হয়।

মেথিলেশন-নির্দিষ্ট পিসিআর

এই কৌশলটি জিনোমে সিপিজি দ্বীপগুলি সনাক্ত করার জন্য ব্যবহৃত হয়। মিথাইলেশন-নির্দিষ্ট পিসিআর-তে, ডিএনএ সোডিয়াম বিসালফেটের সাহায্যে চিকিত্সা করা হয়, যা নিরক্ষিত সাইটোসিন বেসকে ইউরাকিতে রূপান্তরিত করে, যা পিসিআর প্রাইমার থাইমাইন বেসগুলি দ্বারা চিহ্নিত / স্বীকৃত। পরিবর্তিত ডিএনএতে প্রাইমারের সিপিজি দ্বীপপুঞ্জ ব্যতীত অভিন্ন প্রাইমার সেট ব্যবহার করে দুটি ভিন্ন পিসিআর সেট বাহিত হয়। প্রাইমার সেটগুলি সাইটোসিন ঘাঁটিগুলি সনাক্ত করে এবং অন্যান্য সেটগুলির প্রাইমারগুলি অনিয়মিত ডিএনএকে প্রশস্ত করতে ইউরাকিলকে সনাক্ত করে। কিউ-পিসিআর মেথিলেশন সম্পর্কিত পরিমাণগত তথ্য জানার জন্যও সঞ্চালিত হতে পারে। 

বিভিন্ন ধরণের পিসিআর সম্পর্কিত ধারণাগত এমসিকিউ (সমাধান করা)

প্রশ্ন 1: একজন গবেষক একটি পিসিআর প্রশস্ত ডিএনএ খণ্ডের মাঝে পাঁচটি ধারাবাহিক বেস জোড়া পরিবর্তন করার চেষ্টা করছেন। এই জাতীয় পরীক্ষা করার জন্য কোন কৌশলটি সবচেয়ে বেশি পরামর্শ দেওয়া হয়?

উঃ ডিএনএ বন্ধন

বি- বৈদ্যুতিন গতিশীলতা শিফট অ্যাস (EMSA)

সি- পিসিআর মিউটেজেনসিস

ডি- সীমাবদ্ধতা এনজাইম হজম

সঠিক উত্তর: অপশন সি পিসিআর মিউটেজেনসিস 

ব্যাখ্যা:

এই জাতীয় পরিবর্তনগুলির জন্য সর্বাধিক প্রস্তাবিত কৌশল হ'ল পিসিআর মিউটেজেনসিস। এটি প্রাইমার সংশ্লেষ করতে পারে যা মিউটাজেনসিসের কাঙ্ক্ষিত সাইটে অসম্পূর্ণভাবে আবদ্ধ হয়। এই প্রাইমারগুলিতে এখন নতুন ডিএনএ স্ট্র্যান্ডে প্রবর্তনের জন্য নতুন 5-বেস জুটি ক্রম থাকবে। প্রথমত, পিসিআর ডিএনএ টুকরোটিকে মিউট্যান্ট সিকোয়েন্স এবং আপস্ট্রিম সিকোয়েন্সগুলি প্রসারিত করবে। পিসিআর দ্বিতীয় চক্রটি নতুন ডিএনএ স্ট্র্যান্ডকে মিউট্যান্ট সিকোয়েন্স এবং ডাউন স্ট্রিম সিকোয়েন্সগুলি বাড়িয়ে তুলবে। এবং পিসিআর এর চূড়ান্ত চক্রটি পূর্ণ দৈর্ঘ্যের ডিএনএ স্ট্র্যান্ডকে প্রশস্ত করতে মূল প্রাইমারগুলি ব্যবহার করে দুটি টেম্পলেট থেকে একটি ডিএনএ খণ্ডকে প্রশস্ত করবে।

প্রশ্ন 2: পলিমারেজ চেইন বিক্রিয়া (পিসিআর) ডিএনএ স্ট্র্যান্ডকে প্রশস্ত করতে তাপ-স্থিতিশীল পলিমেরেজ (টাক পলিমেরেজ) ব্যবহার করে। বিবৃতিগুলির মধ্যে কোনটি পিসিআর-এর জন্য তাপ-স্থিতিশীল পলিমেরেস প্রয়োজন তা সর্বোত্তমভাবে বর্ণনা করে?

এ- পিসিআরকে তাপ সাইকেল চালানো দরকার, এবং টাক পলিমেরেসগুলি নিষ্ক্রিয় করা যায় যেহেতু নিম্ন-তাপমাত্রার পদক্ষেপের সময় তাদের প্রয়োজন হয় না। 

বি- তাপ স্থিতিশীল (টাক) পলিমারেস তাপমাত্রা খুব বেশি না হলে dsDNA ভাঙবে না। সুতরাং একটি তাপ-স্থিতিশীল (তাক) পলিমেরেজ প্রয়োজন।

সি- পিসিআর তাপ সাইক্লিং প্রয়োজন, এবং তাপ-স্থিতিশীল (টাক) পলিমারেস উচ্চ তাপমাত্রা (95) সময় ডিএনএ পলিমারাইজেশন কার্যকারিতা হারাতে অস্বীকার করবে নাoগ) পদক্ষেপ। 

ডি- উচ্চ-তাপমাত্রার পদক্ষেপের সময় ডিভেলেন্ট ক্যাশনস এবং ডিএনএ পলিমারেজের মধ্যে মিথস্ক্রিয়া অনেক কার্যকর। সুতরাং পিসিআর তাপ-স্থিতিশীল ডিএনএ পলিমেরেজ প্রয়োজন।

ই- তাপ স্থিতিশীল (টাক) পলিমেরেসগুলি স্ট্যান্ডার্ড পলিমেরেসের চেয়ে সস্তা; সুতরাং, তারা ডিএনএ পরিবর্ধনের জন্য আরও উপযুক্ত। 

সঠিক উত্তর: বিকল্প সি

পিসিআর তাপ সাইকেল চালানোর প্রয়োজন, এবং তাপ-স্থিতিশীল (টাক) পলিমেরেস উচ্চ তাপমাত্রা (95) এর সময় ডিএনএ পলিমারাইজেশন কার্যকারিতা হারাতে অস্বীকার করবে নাoগ) পদক্ষেপ। এটি বিভিন্ন ধরণের পিসিআর মধ্যে এটি অনন্য করে তোলে।

ব্যাখ্যা:

পলিমেরেসগুলি প্রায়শই উচ্চ তাপমাত্রায় অস্বীকার করে। যদি একটি স্ট্যান্ডার্ড পলিমারেজ ব্যবহার করা হয়, তবে এটি উচ্চ তাপমাত্রা (স্বচ্ছলতা) পদক্ষেপের সময় অস্বীকার করবে, যা ডাবল-প্রসারিত ডিএনএকে একক স্ট্র্যান্ডেড ডিএনএ টেম্পলেটগুলিতে ভাঙ্গার জন্য প্রয়োজনীয়। এই তাপ-স্থিতিশীল (তাক) পলিমেরেজ ব্যবহার করে, এনজাইম অস্বীকার করবে না। ডিএনএ স্ট্র্যান্ডগুলি পিসিআর শুরুর দিকে যুক্ত পলিমেরেজকে বাড়িয়ে দিয়ে চলবে।

প্রশ্ন 3: পিসিআর এর তিনটি ধাপের সঠিক ক্রমটি কী?

উ: প্রসার, অলঙ্করণ, অ্যানিলিং

বি- অস্বচ্ছলতা, অ্যানিলিং, এক্সটেনশন 

সি- অ্যানিলিং, এক্সটেনশান, অবনতি

ডি- অস্বচ্ছলতা, প্রসার, অ্যানেলিং

সঠিক উত্তর: বিকল্প বি

অবনতি, অ্যানিলিং, এক্সটেনশন 

ব্যাখ্যা:

পিসিআর এর পদক্ষেপগুলি হ্রাসকরণ, অ্যানেলিং এবং এক্সটেনশন জড়িত।

ডাবল-স্ট্র্যান্ডড ডিএনএর হাইড্রোজেন বন্ধনগুলি ভাঙ্গতে প্রায় 94-98 ° সেন্টিগ্রেড তাপমাত্রায় ডেনাটারেশন করা হয়। 

আনিলিং হ'ল পিসিআর-এর দ্বিতীয় ধাপ 50-65 ° সেন্টিগ্রেডে পূর্ণ হয়। একক স্ট্র্যান্ডের সাথে প্রাইমারের সংযুক্তির জন্য অ্যানিলিং পদক্ষেপটি কম তাপমাত্রায় করা উচিত তবে অনির্দিষ্ট হাইব্রিডাইজেশন এড়াতে যথেষ্ট উচ্চ। 

পিসিআর এর প্রসার বা প্রসারিত পদক্ষেপ ডিএনএ পলিমারেজকে টেমপ্লেট ডিএনএ স্ট্র্যান্ডের সর্বশেষ প্রতিলিপি সংশ্লেষ করতে দেয় allows সর্বোত্তম তাপমাত্রা ডিএনএ পলিমারেজ ব্যবহৃত হচ্ছে তার উপর নির্ভর করে তবে সাধারণত 75-80 ডিগ্রি সেন্টিগ্রেড হয়।

প্রশ্ন 4: নীচের মধ্যে কোনটি পলিমারেজ চেইন বিক্রিয়া মিশ্রণের উপাদান নয় / নয়?

উঃ বাফার সলিউশন

বি- ডিএনএ পলিমেরেজ

সি- ফর্মামাইড

ডি- ডিএনএ টেম্পলেট স্ট্র্যান্ড

সঠিক উত্তর: বিকল্প সি

Formamide

ব্যাখ্যা:

পিসিআর এর উপাদানগুলি হ'ল ডিএনএ (টাক) পলিমেরেজ, বাফার, প্রাইমারস, ম্যাগনেসিয়াম ক্লোরাইড, ডিএনটিপি (অ্যাডেনিন, গুয়ানিন, সাইটোসিন, থাইমাইন), ডিওক্সিনুক্লাইটাইড ট্রাইফোসফেটস এবং ডিএনএ টেম্পলেট স্ট্র্যান্ড।

উপসংহার

এই নিবন্ধে আমরা বিভিন্ন ধরণের পিসিআর নিয়ে আলোচনা করেছি। এই বিষয়ে আরও তথ্যের জন্য দেখুন বিভিন্ন ধরণের পিসিআর.

আরও বিষয়ের জন্য জৈব সংশ্লেষ এবং জৈবপ্রযুক্তি আপনি আমাদের পৃষ্ঠাগুলি দেখতে পারেন।

ডাঃ আবদুল্লাহ আরসালান সম্পর্কে

আমি আবদুল্লাহ আরসালান, বায়োটেকনোলজিতে আমার পিএইচডি সম্পন্ন করেছি। আমার গবেষণার years বছরের অভিজ্ঞতা আছে। আমি এখন পর্যন্ত আন্তর্জাতিক খ্যাতিসম্পন্ন জার্নালগুলিতে 7 এর গড় প্রভাব ফ্যাক্টর সহ আরও 6 টি প্রবন্ধ প্রকাশ করেছি এবং আরও কয়েকটি বিবেচনায় রয়েছে। বিভিন্ন জাতীয় ও আন্তর্জাতিক সম্মেলনে আমি গবেষণামূলক প্রবন্ধ উপস্থাপন করেছি। আমার আগ্রহের বিষয় হ'ল বায়োটেকনোলজি এবং জৈব রসায়ন যা প্রোটিন রসায়ন, এনজাইমোলজি, ইমিউনোলজি, বায়োফিজিক্যাল কৌশল এবং আণবিক জীববিজ্ঞানের উপর বিশেষ জোর দেয়।

লিঙ্কডইন (https://www.linkedin.com/in/abdullah-arsalan-a97a0a88/) বা গুগল পণ্ডিতের (https://scholar.google.co.in/citations?user=AeZVWO4AAAAJ&hl=en) এর মাধ্যমে সংযোগ করি।

লাম্বদা গিক্স