ডিএনএ এর বিকৃতকরণ কি: 9 টি উত্তর আপনার জানা উচিত

বিষয়বস্তু

ডিএনএ এর বিকৃতকরণ

সময় প্রতিলিপি DNA এর এবং অন্যান্য বিভিন্ন ঘটনা যেখানে ডিএনএ ডাবল হেলিক্সের স্ট্র্যান্ডের বিচ্ছিন্নতার সাথে ডিএনএর সক্রিয় অংশগ্রহণ পরিলক্ষিত হয়।

ডিএনএ ডাবল হেলিক্সের স্ট্র্যান্ডগুলিকে উচ্চ তাপমাত্রায় দ্রবীভূত ডিএনএ গরম করে আলাদা করা যেতে পারে। হাইড্রোজেন বন্ধনের ব্যাঘাতের কারণে ডিএনএর স্ট্যান্ডগুলি আলাদা হয় যা বিপরীত স্ট্র্যান্ডগুলিতে উপস্থিত পরিপূরক নাইট্রোজেনাস বেসগুলিকে একত্রে ধরে রাখে। এই ঘটনাটি ডিএনএ গলে যাওয়া নামে পরিচিত।

স্থিতিশীল বাহিনী
চিত্র: মধ্যে উপস্থিত হাইড্রোজেন বন্ড নিউক্লিওটাইড বেস জোড়া হল DNA এর প্রধান স্থিতিশীল শক্তি। ইমেজ ক্রেডিট: উইকিপিডিয়া

গলে যাওয়ার মাত্রা গলে যাওয়া তাপমাত্রা (Tm) দ্বারা নির্ধারিত হয় যা তাপমাত্রা হিসাবে চিহ্নিত করা হয় যেখানে ডবল হেলিকাল গঠনের প্রায় 50% হারিয়ে যায়।

ডিএনএ ডাবল হেলিক্সের স্ট্র্যান্ডগুলিও ক্ষার বা অ্যাসিড যোগ করে আলাদা করা যেতে পারে, হাইড্রোজেন বন্ধনগুলি আয়নকরণের দ্বারা ব্যাহত হয়।

ডাবল হেলিকাল ডিএনএ বেস পেয়ার স্ট্যাকিংয়ের কারণে ডিএনএর একক স্ট্র্যান্ডের তুলনায় কম UV আলো শোষণ করে। যখন ডিএনএ গলে যায়, তখন একক আটকে থাকা ডিএনএর শতাংশ বৃদ্ধি পায় যার ফলে ইউভি শোষণ প্রোফাইল বৃদ্ধি পায়। এই ঘটনাটি হাইপারক্রোমিসিটি নামে পরিচিত। এইভাবে, 260 এনএম-এ শোষণ পরিমাপ করে বিকৃতকরণ বা গলে যাওয়ার পরিমাণ নিরীক্ষণ করা যেতে পারে।

ডিএনএ এর বিকৃতকরণ
চিত্র: ডিএনএ বিকৃতকরণ প্রক্রিয়ার পরিকল্পিত উপস্থাপনা। ইমেজ ক্রেডিট: উইকিমিডিয়া

ডিএনএ এর পুনর্গঠন

তাপমাত্রা T-এর নিচে নেমে গেলে DNA-এর বিচ্ছিন্ন স্ট্র্যান্ডগুলি অবিলম্বে অ্যানিল হতে শুরু করেm মান এই annealing চক্র প্রায়ই renaturation হিসাবে বলা হয়. ডিএনএ-এর সর্বোত্তম জৈবিক কার্যকারিতার জন্য বিকৃতকরণ এবং পুনর্নবীকরণের বৈশিষ্ট্য খুবই গুরুত্বপূর্ণ।

সেলুলার পরিবেশে, ডিএনএর স্ট্র্যান্ডগুলি তাপ বা চরম pH এর ক্রিয়া দ্বারা নয় শক্তির ব্যয়ের (ATP) উপর হেলিকেস এবং টপোইসোমারেজের মতো এনজাইমের ক্রিয়া দ্বারা পৃথক করা হয়।

ডিএনএ-এর ক্ষমতা বিপরীতভাবে বিকৃতকরণ এবং পুনঃপ্রতিক্রিয়া করার ক্ষমতা জিনের অভিব্যক্তি এবং একটি জিনের অবস্থান এবং গঠন সম্পর্কে প্রমাণ দেয়।

উদাহরণস্বরূপ বলুন, যদি দুটি স্বতন্ত্র জীবন্ত প্রাণীর ডিএনএ কণাগুলি বিকৃত হয়ে যায় এবং একে অপরের সাথে পুনরায় মিলিত হতে বা হাইব্রিডাইজ করার অনুমতি দেয়। ক্রমগুলি একে অপরের অনুরূপ হলে স্ট্র্যান্ডগুলি ডিএনএ হাইব্রিড গঠন করবে। হাইব্রিডাইজেশনের ব্যাপ্তি দুটি জীবের ডিএনএর মধ্যে সাদৃশ্যের পরিমাণ নির্দেশ করে।

জিন সনাক্ত করতে কোষের ভিতরে ডিএনএ এবং আরএনএ দিয়ে অনুরূপ পর্যবেক্ষণ করা যেতে পারে।

ডিএনএর তাপীয় বিকৃতকরণ

ডিএনএ তাপের মাধ্যমে বিকৃত হতে পারে এবং এই প্রক্রিয়াটি গলে যাওয়ার মতোই। ডিএনএ খুলে না যাওয়া এবং দুটি স্ট্র্যান্ড আলাদা না হওয়া পর্যন্ত নমুনাটি উত্তপ্ত হয়। যখন স্ট্র্যান্ডগুলি আলাদা করা হবে, তখন ডিএনএকে সেই সময়ে একটি স্থির তাপমাত্রায় পৌঁছানোর অনুমতি দেওয়া হবে। এই প্রক্রিয়াটি স্ট্র্যান্ডগুলিকে ডিএনএ হেলিক্সে আকৃতি দেওয়ার অনুমতি দেয়, যা সেই সময়ে পরিপূরক জোড়া তৈরি করে যা চিহ্নিতকারী হিসাবে নেওয়া যেতে পারে।

স্বতন্ত্র প্রজাতির মধ্যে পার্থক্য অনুসন্ধান করার সময় তাপীয় বিকৃতি প্রতিবার ব্যবহার করা হয়। তবে ডিএনএ বিকৃতকরণ বা গলে যাওয়া একটি সত্যিকারের সহজ এবং সরাসরি প্রক্রিয়া, যখন নির্ভুলতার প্রয়োজন হয় তখন এটি ব্যবহার করা হয় না। তাপীয় ডিএনএ বিকৃতকরণকে ডিএনএ সিকোয়েন্সিংয়ের চেয়ে কম সুনির্দিষ্ট হিসাবে দেখা হয় এবং অনেক বিস্তৃত অ্যাপ্লিকেশনের জন্য ব্যবহার করা হয়। পলিমারেজ চেইন রেসপন্সের অভ্যন্তরে এই ধরনের বিকৃতকরণ একইভাবে ব্যবহার করা যেতে পারে।

Tm
চিত্র: ডিএনএর তাপীয় বিকৃতকরণ প্রোফাইল। উচ্চ তাপমাত্রা স্ট্র্যান্ড বিচ্ছেদকে উৎসাহিত করে এবং যে তাপমাত্রায় ডিএনএ-র অর্ধেক আলাদা হয়ে যায় তা গলানো তাপমাত্রা বা টি নামে পরিচিতm। চিত্র ক্রেডিট: উইকিমিডিয়া

NaOH চিকিত্সার মাধ্যমে ডিএনএ বিকৃতকরণ

ডিএনএ নমুনা গরম করার পাশাপাশি, NaOH-এর মতো রাসায়নিকগুলিও ডিএনএর বিকৃতকরণ অর্জন করতে ব্যবহার করা যেতে পারে। NaOH এর একটি নির্দিষ্ট ঘনত্ব DNA ডিনেচার করতে ব্যবহার করা যেতে পারে। ব্যবহার করা NaOH এর পরিমাণ কমে যাওয়ায়, বিকৃতকরণে প্রত্যাশিত সময়ের চেয়ে বেশি সময় লাগবে - তবুও ডিএনএ যে কোনো ক্ষেত্রে সম্পূর্ণরূপে বিকৃত হতে পারে। NaOH ডিএনএর সম্পূর্ণ বিকৃতকরণের জন্য সম্ভবত সেরা এবং দক্ষ কৌশল হিসাবে প্রদর্শিত হয়েছে।

বিভিন্ন রাসায়নিক এজেন্ট, উদাহরণস্বরূপ, ফরমামাইড, দ্রুত ডিএনএ ডিনেচার করতে পারে না। যেহেতু NaOH বিভিন্ন ঘনত্বে ব্যবহার করা যেতে পারে, তাই কোনো সমস্যা ছাড়াই নিরীক্ষণ করাও সহজ। তদুপরি, যে ডিএনএটি NaOH দিয়ে বিকৃত করা হয় তা ফসফেটের বাফার দ্রবণ ব্যবহার করে পুনর্বিন্যাস করা যেতে পারে। ডিএনএ যা বিভিন্ন রাসায়নিক এজেন্টের মাধ্যমে বিকৃত করা হয়, যেমন DMSO (ডাইমেথাইলসালফক্সাইড), এইভাবে সম্পূর্ণরূপে পুনর্বিন্যাস করা যায় না - এবং এর ফলে আরও অ্যাপ্লিকেশনের জন্য NaOH ব্যবহার হতে পারে। 

লবণের মাধ্যমে ডিএনএ ডিনাচুরেশন

লবণের সঠিক অনুপাতের ভিত্তিতে মাঝারি উচ্চ পরিমাণে লবণ ডিএনএকে সাধারণত বিকৃত করে তোলে। লবণ ব্যবহার করে ডিএনএ বিকৃতকরণ জৈব দ্রাবক ব্যবহার করে বিকৃতকরণের মতো। সাধারণত, লবণ ব্যবহার করে ডিএনএ বিকৃতকরণ পুনর্বিন্যাস করা যায় না। ডিএনএ সম্পূর্ণরূপে বিকৃত করার জন্য একটি অ্যাসিডের জায়গায় প্রায়শই লবণ ব্যবহার করা হয়, এবং এটি একইভাবে তাপের সাথে ব্যবহার করা যেতে পারে। লবণকে সাধারণত বিকৃতকরণের একমাত্র এজেন্ট হিসাবে ব্যবহার করা হয় না - এটি সাধারণত কিছু ভিন্ন রাসায়নিক যৌগ যেমন আইসোপ্রোপ্যানল এবং ইথানলের সাথে ব্যবহার করা হয়।

এই প্রক্রিয়াটি ডিএনএ-র বড় ভলিউম ডিনেচার করার জন্য ব্যবহার করা যেতে পারে, যা এটিকে সুস্পষ্ট কাজের জন্য কম সহায়ক করে তোলে, তবে বেশি পরিমাণে ডিএনএ বৃদ্ধি এবং প্রক্রিয়াকরণের জন্য আরও মূল্যবান।

তবে ডিএনএ বিকৃতকরণের সাথে সম্পর্কিত অসংখ্য পদ্ধতি রয়েছে, চূড়ান্ত পণ্যটি একই রকম: স্ট্র্যান্ডগুলির মধ্যে সংযোগগুলি ভেঙে যায় এবং একক আটকে থাকা ডিএনএ তৈরি হয়, যা বিভিন্ন পদ্ধতি দ্বারা নির্ধারণ করা যেতে পারে। ডিএনএ বিকৃতকরণের সর্বোত্তম পদ্ধতি নির্ভর করে কিসের জন্য ডিএনএ ব্যবহার করা উচিত, পারস্পরিক সম্পর্ক কতটা সঠিক এবং সুস্পষ্ট হওয়া উচিত এবং প্রক্রিয়াজাত করা আবশ্যক উপাদানের পরিমাণ।

একটি নিয়ম হিসাবে, উভয় তাপ এবং লবণ বিকৃতকরণ সহজে স্কেল করা যেতে পারে এবং বড় পরিমাণে ব্যবহার করা যেতে পারে, যখন NaOH ডিনাচুরেশন সামান্য পরিমাণে ডিএনএর জন্য আরও সুনির্দিষ্ট এবং মূল্যবান হতে পারে।

ফরমামাইড ডেন্টুরেশন
চিত্র: ফরমামাইডের মাধ্যমে ডিএনএ বিকৃতকরণের প্রক্রিয়া। ইমেজ ক্রেডিট: উইকিমিডিয়া

কোন পিসিআর পদক্ষেপের কারণে ডবল স্ট্র্যান্ডেড ডিএনএ বিকৃত হয়

ডিএনএ স্ট্র্যান্ডের বিচ্ছিন্নতা বিকৃতকরণ ধাপে সঞ্চালিত হয় পলিমারেজ চেইন রিঅ্যাকশন (পিসিআর) যা নিম্নলিখিত ধাপে বর্ণনা করা হয়েছে:

ডিএনএ বিকৃতকরণের উপর ইউরিয়ার প্রভাব

ডিএনএ-র তাপীয় এবং পিএইচ-প্ররোচিত বিকৃতকরণের মতো, ইউরিয়াও ডিএনএ বিকৃত করার ক্ষমতা রাখে। উচ্চ পরিমাণে ইউরিয়া নিউক্লিক অ্যাসিড কাঠামোর জন্য একটি সমস্যাযুক্ত অবস্থার সমাধান করে। যেহেতু ইউরিয়া হাইড্রোজেন-বন্ড দাতা এবং সেইসাথে গ্রহণকারী, এটি নিঃসন্দেহে নিউক্লিক অ্যাসিডকে বিকৃত করতে পারে। প্রকৃতপক্ষে, 6-8 এম ইউরিয়া হল পলিঅ্যাক্রাইলামাইড জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস (dPAGE) বিকৃত করার জন্য গুরুত্বপূর্ণ উপাদান যা আকারের ভিত্তিতে ডিএনএ অলিগোনিউক্লিওটাইডগুলিকে আলাদা করার জন্য ব্যাপকভাবে ব্যবহৃত হয়। এই কৌশলে, ডিএনএ ডাবল হেলিসগুলি সম্পূর্ণরূপে বিকৃত হয় এবং পলিঅ্যাক্রিলামাইড/অ্যাগ্রোজ জেলে রৈখিক পলিমার হিসাবে ভ্রমণ করে।

আমাদের অবিশ্বাস্য আশ্চর্যের জন্য, আমরা একটি ডিএনএ কণার উপরে গিয়েছিলাম যা 7 M ইউরিয়া (7MU) এ একটি ভাঁজ করা কাঠামো তৈরি করতে পারে, যা 7MU-dPAGE চক্রের সময় স্থিতিশীল থাকে। এটি এই কারণে যে এই ডিএনএতে গুয়ানিন নিউক্লিওটাইডের খুব বেশি ঘনত্ব ছিল এবং এটি কোয়াড্রুপ্লেক্স কাঠামো তৈরি করেছিল।

উপসংহার

এই নিবন্ধে আমরা ডিএনএ ডিনাচুরেশন সম্পর্কে আলোচনা করেছি যা আণবিক জীববিজ্ঞানের ক্ষেত্রে খুব ঘন ঘন শোষিত হয় একটি কার্যকরী হাতিয়ার হিসাবে পরিবর্তন করার জন্য এবং রিকম্বিন্যান্ট ডিএনএ গঠনের জন্য। আমরা বিভিন্ন ডিনাচুরেন্টের আলোকে বিকৃতকরণ নিয়ে আলোচনা করেছি যা স্থিতিশীল শক্তিকে বিরক্ত করতে পরিচিত। ডিএনএ কাঠামো.

সাক্ষাত্কার প্রশ্নোত্তর

প্রশ্ন 1 কেন ডিএনএ বিকৃত হয়?

উত্তর: আমরা জানি যে প্রতিটি জীবন্ত কোষের সঠিকভাবে কাজ করার জন্য ডিএনএর স্থিতিশীলতা গুরুত্বপূর্ণ। কিন্তু, এমন কিছু ঘটনা রয়েছে যেখানে কোষের স্বাভাবিক জীবন প্রক্রিয়া চালানোর জন্য উপকারী ডিএনএ-র বিকৃতকরণ। ডিএনএ ডিনেচার করে দুটি পলিনিউক্লিওটাইড স্ট্র্যান্ড তৈরি করে, এটি নির্দিষ্ট এনজাইমের সাহায্যে সঞ্চালিত হয় যেমন গাইরেস, টপোইসোমারেজ এবং হেলিকেস এবং ডিনাচুরেশনটি প্রায়শই স্থানীয়করণ করা হয়।

গুরুত্বপূর্ণ সেলুলার প্রক্রিয়া যেমন ডিএনএর প্রতিলিপি এবং প্রতিলিপির জন্য ডিএনএ আলাদা করা প্রয়োজন। পলিমারেজ চেইন রিঅ্যাকশন, ডিএনএ ফিঙ্গারপ্রিন্টিং ইত্যাদির মতো উন্নত আণবিক জীববিজ্ঞান কৌশলগুলি প্রায়শই বিকৃতকরণের ঘটনা ব্যবহার করা হয়।

প্রশ্ন 2 বিকৃতকরণের কারণ কী?

উত্তর: ডিএনএ স্ট্র্যান্ডগুলি হাইড্রোজেন বন্ধনের মতো অ সমযোজী মিথস্ক্রিয়া দ্বারা একসাথে রাখা হয়। এই হাইড্রোজেন বন্ধনগুলি ভাঙার ফলে ডিএনএর স্ট্র্যান্ডগুলি আলাদা হয়ে যায় যা ডিএনএ-এর বিকৃতকরণ নামে পরিচিত। ডিএনএর নিউক্লিওটাইডগুলির মধ্যে উপস্থিত হাইড্রোজেন বন্ধন বিভিন্ন উপায়ে ভাঙ্গা যেতে পারে।

  • তাপ দ্বারা ডিএনএ এর বিকৃতকরণ: DNA এর তাপীয় বিকৃতকরণ
  • চরম pH দ্বারা DNA এর বিকৃতকরণ: ডিএনএ-এর পিএইচ-প্ররোচিত বিকৃতকরণ
  • লবণ দ্বারা ডিএনএ বিকৃতকরণ: স্যালাইন DNA এর বিকৃতকরণকে প্ররোচিত করে

Q3 ডিএনএ-এর বিকৃতকরণকে প্রভাবিত করে

উত্তর: ডিএনএর বিকৃতকরণ নিম্নলিখিত বিষয়গুলির উপর নির্ভর করে

  • তাপমাত্রা: প্রতিটি জীবের ডিএনএ-এর একটি নির্দিষ্ট গলে যাওয়া/ডিনাচুরেশন তাপমাত্রা থাকে
  • pH: চরম pH এ DNA denatures
  • অসমোলারিটি এবং লবণাক্ততা: অতিরিক্ত লবণের ঘনত্বও ডিএনএ-এর বিকৃতকরণকে প্ররোচিত করে
  • গুয়ানিন-সাইটোসিন সামগ্রী: ডিএনএ-তে GC সামগ্রী যত বেশি হবে, গলে যাওয়ার তাপমাত্রা তত বেশি হবে
  • এডেনাইন-থাইমিন উপাদান: ডিএনএ-তে এটি যত বেশি, গলে যাওয়ার তাপমাত্রা কম হবে

Q4 DNA এর বিকৃতকরণ তাপমাত্রা

উত্তর: যখন ডিএনএ দ্রবণ 90 এর উপরে উত্তপ্ত হয়oসি, গতিশক্তির বৃদ্ধি ডিএনএর দুটি স্ট্র্যান্ডের মধ্যে উপস্থিত নন-কোভ্যালেন্ট হাইড্রোজেন বন্ডগুলিকে বিরক্ত করার জন্য যথেষ্ট। এই অ-সমযোজী মিথস্ক্রিয়া ডিএনএ স্থিতিশীল করার জন্য দায়ী। এই শক্তিগুলির ব্যাঘাত ডিএনএ এর বিকৃতকরণের দিকে পরিচালিত করে। সাধারণত প্রতিটি জীবের ডিএনএর গলে যাওয়া তাপমাত্রা 90-এর উপরে থাকেoC.

প্রশ্ন 5 কোন তাপমাত্রায় DNA ডাবল হেলিক্সের বিকৃতকরণ ঘটে?

উত্তর: সাধারণত, একটি জীবের ডিএনএর গলে যাওয়া বা বিকৃতকরণ তাপমাত্রা 90 এর কাছাকাছি বা তার বেশিoC.

প্রশ্ন 6 কিভাবে DNA এর বিকৃতকরণ এর গঠন বিশ্লেষণ করতে সাহায্য করে?

উত্তর: যখন ডিএনএ-র বিকৃতকরণ শুরু হয়, তখন 260 এনএম-এ ইউভি শোষণ ধীরে ধীরে বৃদ্ধি পায় এবং ডিএনএর দুটি স্ট্র্যান্ড সম্পূর্ণরূপে পৃথক না হওয়া পর্যন্ত সর্বোচ্চে পৌঁছায়। ইউভি শোষণের পরিবর্তনটি বিকৃতকরণ এবং পুনর্নবীকরণের ডিগ্রি সম্পর্কে একটি ধারণা দেয়।

Q7 বিকৃত ডিএনএ কেন ধ্বংস হয় না?

উত্তর: ডিএনএ-এর বিকৃতকরণ ঘটে অ-সমযোজী মিথস্ক্রিয়া ভেঙ্গে যাওয়ার কারণে এইভাবে এটি শুধুমাত্র বিকৃত হয় না ধ্বংস হয়। পলিনিউক্লিওটাইড স্ট্র্যান্ডগুলি চিনির ফসফেট দিয়ে গঠিত ব্যাকবোন সমযোজী সংযোগ (বন্ড) দ্বারা গঠিত যা বিকৃতকরণ প্রক্রিয়ার সময় ভেঙে যায় না।

প্রশ্ন 8 ডিএনএ বিকৃতকরণ কি বিপরীতমুখী?

উত্তর: হ্যাঁ, ডিএনএ বিকৃতকরণ প্রক্রিয়া বিপরীতমুখী। যখন তাপমাত্রা কম হয়, ডিএনএ-এর বিচ্ছিন্ন স্ট্র্যান্ডগুলি এর কারণে পুনরায় মিলিত হতে শুরু করে হাইড্রোজেন বন্ড গঠন ডিএনএ-এর পরিপূরক অনুক্রমের মধ্যে। ডিএনএর পুনঃস্থাপন ডিএনএ ডাবল হেলিকাল কাঠামোর পুনরুদ্ধারকে উৎসাহিত করে এবং তাই ডিএনএ বিকৃতকরণ একটি বিপরীত প্রক্রিয়া।

প্রশ্ন 9 কেন প্রোটিনের চেয়ে ডিএনএ ডিনেচার করা সহজ?

উত্তর: ডিএনএ এবং প্রোটিন উভয়ই তাপ, চরম pH, উচ্চ লবণের ঘনত্ব এবং অন্যান্য রাসায়নিক ডিনাচুরেন্টের উপস্থিতি ব্যবহার করে বিকৃত করা যেতে পারে। ডিএনএ-এর ডিনাচুরেশন বোঝা সহজ যখন প্রোটিনের ডিনাচুরেশন একটি জটিল ঘটনা কারণ প্রোটিনের গঠন সমযোজী এবং অ-সমযোজী মিথস্ক্রিয়া দ্বারা স্থিতিশীল হয়। কিছু প্রোটিন খুব সহজে ডিনেচার করতে পারে আবার কিছু প্রোটিন খুব চরম অবস্থায় ডিনেচার করে।

প্রশ্ন 10 যদি ডিএনএ প্রোটিন না হয় তাহলে আমরা কেন বলি যে ডিএনএ বিকৃত হতে পারে?

উত্তর: একটি বায়োম্যাক্রোমোলিকুল যখন তার কাঠামোগত অখণ্ডতা হারাতে শুরু করে বা যখন এটি গঠন পরিবর্তন করে তখন তাকে বিকৃত বলা হয়। যেহেতু ডিএনএ-রও একটি সুনির্দিষ্ট কাঠামো রয়েছে, তাই যখন ডিএনএ-এর গঠন পরিবর্তন হয় তখন আমরা বলতে পারি যে ডিএনএ বিকৃত হচ্ছে।

প্রশ্ন 11 কেন ইলেক্ট্রোফোরসিসের সময় নিয়ন্ত্রণগুলি ব্যবহার করা হয়?

উত্তর: যখন আমরা ডিএনএর ইলেক্ট্রোফোরেসিস করি তখন কন্ট্রোল (ইতিবাচক এবং নেতিবাচক) প্রায়ই ব্যবহৃত হয়। আমরা নমুনা ডিএনএর গঠনের স্থিতি পরীক্ষা করতে নিয়ন্ত্রণ ব্যবহার করি (সেটি ডাবল স্ট্র্যান্ডেড, সিঙ্গেল স্ট্র্যান্ডেড, আংশিক ডাবল স্ট্র্যান্ডেড, নিকড ইত্যাদি)। ডাবল স্ট্র্যান্ডেড ডিএনএ অ্যাগারোজ জেলে একক আটকে থাকা ডিএনএর তুলনায় দ্রুত চলে যখন নিকড ডিএনএ সবচেয়ে ধীর গতিতে চলে।

আগারোজ জেল
চিত্র: DNA এর Agarose জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস। ইমেজ ক্রেডিট: উইকিমিডিয়া

Q12 DNA ক্ষতিগ্রস্ত হলে কি হয়?

উত্তর: ক্ষতিগ্রস্ত বা ছিন্ন ডিএনএ সবচেয়ে ধীর গতিতে চলে, পিছিয়ে যায় এবং কম গতিশীলতা থাকে। এইভাবে নিক বা ক্ষতিগ্রস্ত ডিএনএ অ্যাগারোজ জেল ইলেক্ট্রোফোরসিসে স্বল্প দূরত্ব কভার করে।

Q13 প্রোটিনের বিকৃতকরণ ঘটলে কোন বন্ধন প্রথমে ভেঙে যায়?

উত্তর: অন্যান্য নন-কোভ্যালেন্ট মিথস্ক্রিয়া (হাইড্রোফোবিক, ভ্যান্ডার ওয়াল ফোর্স) সহ হাইড্রোজেন বন্ধনগুলি প্রথমে বিঘ্নিত হয় যখন ডিনাচুরেশন প্রক্রিয়া চলাকালীন ডিসালফাইড লিঙ্কেজের মতো সমযোজী মিথস্ক্রিয়াগুলি শেষ পর্যন্ত ভেঙে যায়।

প্রশ্ন 14 ডিএনএ বিকৃতকরণের মধ্য দিয়ে যেতে পারে এই বিষয়টি বিবেচনা করে কীভাবে ডিএনএ তাপ মারা যাওয়া S স্ট্রেন থেকে রুক্ষ R স্ট্রেনে স্থানান্তরিত হয়?

উত্তর: Pnuemococcus এর ভাইরালেন্ট S স্ট্রেনের তাপ হত্যার সময় এর DNA বিকৃত হয়ে যায় কিন্তু, যখন এটি R স্ট্রেনের সাথে মিশ্রিত হয়, তখন তাপমাত্রা তত বেশি হয় না। সুতরাং, মিক্সিং প্রক্রিয়া চলাকালীন ডিএনএ পুনরায় সংযোজিত হতে পারে এবং এর কার্যকারিতা পুনরুদ্ধার করতে পারে।

প্রশ্ন15 প্রোটিনগুলিকে বিকৃত করার অর্থ কি সেগুলিকে আরও মৌলিক অথচ কার্যকরী সনাক্তযোগ্য অংশে বিভক্ত করা?

উত্তর: না, Denaturation শুধুমাত্র biomacromolecules গঠন পরিবর্তন লক্ষ্য করা হয়. কাঠামোর পরিবর্তন এই অণুগুলির কার্যকারিতায় পরিবর্তন বা ক্ষতি নিয়ে আসে। ডিনাচুরেশন মানে মৌলিক একককে ধ্বংস করা বা ভেঙ্গে ফেলা নয়। বিকৃতকরণ হজম নয়।

প্রশ্ন16 তাপগতভাবে স্থিতিশীল ডিএনএ পলিমারেজ এবং সাধারণ ডিএনএ পলিমারেজের মধ্যে পার্থক্য কী?

উত্তর: থার্মো স্থিতিশীল ডিএনএ পলিমারেজ একটি এক্সট্রিমোফাইল ব্যাকটেরিয়া থার্মাস অ্যাকুয়াটিকাস থেকে প্রাপ্ত হয়, এটি সাধারণ ডিএনএ পলিমারেজ থেকে আলাদা কারণ এটি প্রতিলিপি করতে পারে এমনকি 90 এর উপরে তাপমাত্রায়ও ডিএনএরoC.

প্রশ্ন17 কেন দীর্ঘ ডিএনএ হেলিসগুলির বিকৃতকরণ ছোট স্ট্র্যান্ডের বিকৃতকরণের চেয়ে বেশি সহযোগিতা দেখায়?

উত্তর: যেহেতু বৃহত্তর ডিএনএ স্ট্র্যান্ডগুলিতে বেশি নিউক্লিওটাইড থাকে, তাই পরিপূরক বেস জোড়া গঠনের সম্ভাবনা বেশি থাকে, প্রচুর পরিমাণে হাইড্রোজেন বন্ধন তৈরির সম্ভাবনা বেশি থাকে। অতএব, বৃহত্তর ডিএনএ খণ্ডগুলি আরও সহযোগিতা দেখায়।

প্রশ্ন18 কেন NaOH ডিএনএ ডিনেচার করে?

উত্তর: NaOH এর প্রবর্তন মাধ্যমের pH বৃদ্ধি করে এবং এটিকে ক্ষারীয় করে তোলে, NaOH থেকে নিঃসৃত OH আয়ন গুয়ানাইন এবং থাইমিনের সাথে মিথস্ক্রিয়া করে এবং হাইড্রোজেন বন্ধন ভাঙতে উৎসাহিত করে যা শেষ পর্যন্ত ডিএনএ-র বিকৃতকরণের দিকে নিয়ে যায়।

Q19 ফর্মালডিহাইডের কারণে ডিএনএ-এর বিকৃতকরণ কি ডিএনএ ফিঙ্গারপ্রিন্টিংকে প্রভাবিত করতে পারে?

উত্তর: না, ফর্মালডিহাইড ডিএনএ ফিঙ্গারপ্রিন্টিংয়ের ফলাফলকে প্রভাবিত করবে না। যেহেতু ডিএনএ ফিঙ্গারপ্রিন্টিংয়ের জন্য সীমাবদ্ধতা হজমের প্রয়োজন হয় এবং সীমাবদ্ধ এনজাইমগুলি ডবল স্ট্র্যান্ডেড ডিএনএ-তে নির্দিষ্ট ক্রমগুলিকে চিনতে পারে। ফর্মালডিহাইড ডিএনএ ডিনেচার করতে পারে কিন্তু ফর্মালডিহাইড অপসারণের পরে (যেমন এটি শুধুমাত্র ইলেক্ট্রোফোরেসিস করার পরে ফিক্সেশন প্রক্রিয়ায় ব্যবহৃত হয়) ডিএনএ তার আসল রূপে ফিরে আসে এইভাবে, ডিএনএ ফিঙ্গারপ্রিন্টিং প্রভাবিত হয় না।

প্রশ্ন 20 জেল ইলেক্ট্রোফোরসিস করা ব্যতীত সাধারণ ডিএনএ থেকে বিকৃত ডিএনএকে আলাদা করতে পারে এমন কোনো যন্ত্র কি পাওয়া যায়?

উত্তর: হ্যাঁ এমন কিছু সরঞ্জাম এবং যন্ত্র রয়েছে যা গলনের তাপমাত্রা নির্ধারণের জন্য বর্ণালীবিদ্যার নীতিতে কাজ করে এবং তা থেকে আমরা বিকৃত এবং স্বাভাবিক ডিএনএর মধ্যে পার্থক্য করতে পারি। অন্য কৌশলটি হল ডিএনএ নমুনার অ্যাগারোজ জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস।

প্রশ্ন21 টিএম মান যদি টিএম মান এবং ডিএনএ-র বিকৃতকরণের মধ্যে সম্পর্ক বৃদ্ধি পায় তবে ডিএনএ-র বিকৃতকরণের উপর কী প্রভাব পড়ে?

উত্তর: উচ্চ Tm মান নির্দেশ করে যে DNA কাঠামোর তুলনায় কম Tm মান থাকা DNA এর তুলনায় আরও স্থিতিশীলতা রয়েছে।

এছাড়াও পড়ুন:

    মতামত দিন